"Virión" maduro de tipo-1 expuesto VIH-1, con ciertas regiones para mayor claridad

Washington D.C. (EE.UU.), 5 de diciembre de 2014 / Investigación / Gabinete de Prensa.

Una representación simplificada de un "virión" madura de tipo 1 del virus de la inmunodeficiencia humana (VIH-1), con ciertas regiones expuestas para mayor claridad. Un virión es una partícula de virus entero y consiste en una envoltura proteica externa, llamada cápside, y un núcleo interno de ácido nucleico (ya sea ácido ribonucleico o desoxirribonucleico - ARN o ADN).  Los viriones se liberan de la superficie de una célula infectada con el VIH-1 y disponen de estos componentes principales: Una membrana externa que encierra el virión (gris) y una cápside en forma de cono hecha de proteínas especiales (verde) que rodean el material genético del virus (rojo y naranja). software Greg Voth, el P. Haig Papazian Servicio Distinguido Profesor de Química de la Universidad de Chicago, y sus CMTS uso del equipo (CMTS) para modelar eficientemente sistemas como este VIH-1 viriones por división la estructura general en pedazos más pequeños.  Estos trozos más pequeños se examinan en paralelo por un gran número de unidades centrales de procesamiento (CPU) en la supercomputadora Blue Waters, situado en el Centro Nacional para Aplicaciones de Supercomputación (NCSA) de la Universidad de Illinois en Urbana-Champaign. Para ayudar a asegurar que ninguna CPU realiza demasiados cálculos, el software CMTS divide la carga de trabajo general utilizando una curva de Hilbert - un concepto matemático que describe localizaciones en 3D utilizando un solo número.  Un ejemplo de una curva de Hilbert se muestra que rodea el virión, el cambio de color de azul a rojo a medida que avanza por el espacio 3-D. Este material está basado en trabajo apoyado por la Fundación Nacional de Ciencia (NSF) a través del Centro de Multiescala Teoría y Simulación (conceder CHE 11-36.709), las aguas azules sostenido-petaescala proyecto de computación (OCI conceder 07-25.070), y los "petaescala Multiescala simulaciones biomoleculares de Sistemas" asignación NSF PRAC (OCI conceder 10-36184). Blue Waters es apoyado por NSF a través de subvenciones ACI 07-25070 y 12-38993 ACI. Para conocer más sobre esta investigación, vea la noticia NCSA realmente grandes problemas . (Fecha de la Imagen: Enero de 2014)